西番莲在世界各地多数地区有种植,其果肉具有丰富的营养成分,常被加工成果汁食用,但是对果皮的利用较少,造成了资源的浪费。本研究主要从转录组水平对西番莲果皮展开研究,旨在为揭示西番莲果皮花青素生物合成的分子机制和调控机制奠定基础。本研究以紫皮西番莲和黄皮西番莲成熟期与非成熟期四种样品为研究对象,首先,运用响应面法研究了西番莲果皮花青素的最佳提取条件,用该最佳提取条件分别提取四种样品中的花青素。其次,利用Illumina-Hiseq测序平台进行转录组测序,对原始数据进行质控过滤,将Clean Reads比对到西番莲参考基因组。然后,将比对上的基因进行表达定量,再用DESeq2以|log_2Fold Change|≥1,且FDR<0.05条件筛选差异表达基因。将差异表达基因分别与KEGG、GO和KOG数据库进行基因注释,分析基因功能和代谢通路。运用WGCNA分析识别潜在的hub genes,进一步确定其与花青素合成相关性。最后,利用实时荧光定量PCR验证部分hub genes。通过以上研究,得到了如下结果:(1)研究得到最佳提取条件为乙醇浓度78%,提取时间73 min,超声功率345 W,料液比1:45。在此条件下紫皮西番莲成熟期果皮(TPR)、非成熟期果皮(TPU)、黄皮西番莲成熟期果皮(TYR)和非成熟期果皮(TYU)的花青素含量分别为3.329 mg/g,1.073 mg/g,0.897 mg/g,0.877 mg/g。(2)利用Illumina-Hiseq平台对12个样本进行转录组测序,得到原始数据(Raw Reads)5.59亿条,过滤后的Clean Reads 5.35亿条,平均长度150 bp,每个样本的Clean Base均在6 G以上,每个样本的比对率均高于73%。(3)利用DESeq2筛选得到的差异表达基因结果表明:TPR＿vs＿TYR比较有7528个差异表达基因,其中3504个基因表达上调,4024个基因表达下调。TPU＿vs＿TPR比较有3976个差异表达基因,其中1894个基因上调表达,2082个基因表达下调。TPU＿vs＿TYU比较有50ATM/ATR抑制剂39个差异表达基因,其中2272个基因上调表达,2767个基因表达下调。对差异表达基因进行注释,发现在KOG数据库注释上的差异表达基因最多。(4)进行WGCNA分析,对差异表达基因进行聚类并将其划分为10个模块,结合花青素含量,对与花青素含量正负相关性最高的两个模块进一步分析,构建基因共表达网络图,分别筛选了两个模块MCC算法打分最高的10个hub genes。使用实时荧光定量PCR分别验证两个模块中打分最高的5个hub genes,结果符合预期实验设想。上述研究工作填补了西番莲果皮花青素合成转录组研Tamoxifen IC50究的空白,为后续挑选具体的转录因子研究花青素的生物合成转录调控机制奠定了基础,也为花青素的深度开发利用提供数据参考。色泽是评价园艺作物外观品质的重要high-dose intravenous immunoglobulin指标,因此我们的研究不仅是充分利用了西番莲果皮,开发花青素资源,也是为了进一步提高它的外观品质。